En abril de 1998 se iniciaron las negociaciones comerciales entre México e Israel orientadas a la firma de un tratado de libre comercio. Después de diez rondas, los representantes de ambos gobiernos suscribieron un texto el 6 de marzo de 2000, siendo firmado formalmente en la ciudad de México cuatro días más tarde. El canje de instrumentos de ratificación se efectuó el 31 de mayo, por lo que, conforme lo establecido en el mismo Tratado, entró en vigor treinta días después.
Este instrumento presenta las características comunes de los acuerdos de libre comercio de última generación. Una de sus notas más salientes desde el punto de vista metodológico es la incorporación de las listas de productos desgravados y de los requisitos específicos de origen dentro del cuerpo principal del mismo Acuerdo. Con respecto a su contenido, en lo relativo a la liberalización comercial de bienes se fijó un programa de desgravación considerando cuatro etapas anuales subsiguientes a la puesta en vigencia del Acuerdo, incluyendo la desgravación inmediata para un número significativo de líneas arancelarias. Al recorrer las disciplinas contempladas en los distintos capítulos, se advierte una cuidadosa remisión a los preceptos de la OMC (en materias tales como el comercio de servicios, disposiciones sanitarias y fitosanitarias, reglamentos técnicos, lealtad comercial y propiedad intelectual). La promoción y protección de inversiones da lugar a compromisos negociados fuera del Acuerdo. En cambio, son muy minuciosos los capítulos sobre compras gubernamentales y las normas relativas a defensa de la competencia.